宁前屯卫兵备道佥事为主，要求修筑到二百里之外的宁远卫，但王总镇经略却不听从建议。
随后明广宁前屯卫兵备道佥事还两次，直接将意见报告给明内阁首辅，但明内阁首辅因不知前线的情况，拿不定主意。
这时明兵部右侍郎兼詹事府少詹事：孙承宗，自请上奏要亲身前往山海卫关外勘察地形，而由于孙侍郎乃是帝师，所以明熹宗不太舍得让他离开。
但为了稳定朝中局势，还是忍痛割爱让帝师出关勘察。
3月25日，明兵部右侍郎：孙承宗，巡视回朝后建议出关筑守宁远卫要害，与觉华岛形成相犄角，后又面奏明熹宗，称；王总镇经略不太懂军务、不堪胜任，当自请督师。
这让明熹宗大喜，不得不派出帝师总督军务了，便特加明兵部右侍郎：孙承宗，为〈太子太保兼辽东总镇经略〉并赐蟒袍玉带、银币，以示隆礼。
3月27日，朝廷传令贵州承宣布政使司附近各镇派遣精兵应援，并调遣了湖广都指挥使司、云南都指挥使司、广西都指挥使司，这三镇都司4万明军入贵州承宣布政使司救援。
4月11日，李氏朝鲜兵曹判书：申景禛，以吊唁李氏朝鲜平山府使：李贵，出家为尼的女儿：李礼顺，的名义前去拜访李氏朝鲜平山府使，以阐明举事之意，得到赞同。
于是李氏朝鲜平山府使之子李氏朝鲜延阳府院君：李时白、李氏朝鲜汉城府参军：李时昉、李氏朝鲜汉城府儒生：金自点、李氏朝鲜加平郡儒生：沈器远、前任李氏朝鲜兵曹佐郎：崔鸣吉，等人都相继加入到政变集团中，此后预谋效力者较多。
4月14日，明礼部尚书：孙慎行，上疏追论红丸案事件，并弹劾先帝光宗泰昌朝时期的明内阁首辅：方从哲，有包庇明鸿胪寺寺丞：李可灼，的行为？
为此明熹宗下令廷臣商议，参与议论者达一百一十多人，纷纷声讨方阁老有罪，唯独明刑部尚书：黄克缵，及明礼科给事中：汪庆百，等数人为其袒护。
由于事情复杂且有人求情，因此重审此案，以免冤枉忠臣，也能断了流言蜚语。
后来为了平息争论明熹宗宣布废除李可灼官职遣去戍边，明御药房太监：崔文升，则被发配到南直隶应天府南京城皇城打扫
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