承宣布政使司广州府、肇庆府、韶州府、南雄府，江西承宣布政使司南昌府、南直隶苏州府等地进行传教活动，并学习大明江淮官话。
还广泛与大明地方官吏和士大夫接触，以了解大明帝国的国情和风俗礼仪。
之后由南直隶北上，在京畿北直隶天津卫居住了六个月，明天津卫税监：马堂，向朝廷进贡泰西传教士：利玛窦，所献方物，还奏报泰西传教士请求入京的消息。
谁知被大明礼部以《大明会典》不载大西洋，真伪不可知？以及泰西传教士所献之物不宜入宫中，请赐给冠带令其回国，不许在南北两京居住，务与大明汉人交往，别生事端。
然而明神宗却不纳，认为有趣特下诏准许泰西传教士入京。
明万历二十九年公元1601年正月24日，泰西传教士抵达北直隶京畿紫禁城内。
2月初2日，身穿皮弁服的明神宗亲自在紫禁城太极殿内召见番邦使者，此系大明帝国天皇帝陛下亲自接见的第一位欧洲传教士。
而这位泰西传教士：利玛窦，也不负众望地向明神宗进献了；三座天主圣像、圣母像、天主经典、二台自鸣钟、铁弦琴、珍珠嵌十字架，以及世界各地图简称「万国图志」至此大明汉人才知道世界上有五大洲。
明神宗亦待以优礼，赐屋于宣武门内，其所需银、米，冠带等俱由朝廷按时供给。
泰西传教士在传播宗教的同时，还介绍了西方比较先进的科学技术知识，并把大明帝国的传统文化介绍到西方去，叫做（西学东渐）和〈东学西渐〉之事。
2月14日，湖广承宣布政使司武昌府百姓，得知官府派吏役抵达武昌府逮捕明湖广分巡佥事：冯应京，时相率痛哭，愤愤不平，为冯大人呼冤号屈。
因明湖广矿税监：陈奉，利用官职肆意压榨百姓，欺负民女，又残害婴儿，故此被明湖广分巡佥事举报，怎奈这位明湖广矿税监朝中有后台，无人敢动他。
故此明湖广矿税监四处派人，到大街小巷去公布明湖广分巡佥事的罪状，一时间就引起了士民们的公愤。
3月26日，百姓们集合数万人，群起包围陈奉的矿税监衙门，声言；誓必杀奉，吓得陈奉狼狈逃匿到楚亲王府避难，但愤怒的群众遂把其党十六人
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