天皇的母亲是古代朝鲜百济王国一位国王的家族中人。他的依据是日本编年史上的明确记载：“公元781年即位的桓武天皇的母亲就是古代朝鲜百济王国的王族中人。”
不过史学界对此也存有质疑：“明仁天皇之所以这么说，有可能出于其他的目的，比如外交的考量等等。还有即便最后证明是朝鲜人，这无形中给当年日本侵略朝鲜提供了很好的借口。”
血统说之三：亚洲游牧民族?
另有考古证据证实，古代的日本是由众多的部落国家以及自东北亚迁来的游牧民族融合演变而成。当时处于部落战争时期，由于生产力比较发达，所以来自中国和朝鲜的部落大王可能在战争中占据有利的位置，最终统一其它部落，并进而成为第一个天皇。
从陪葬品的考古结果来看，早期天皇古坟的陪葬品以镜、刀为主要祭祀用品。而中期天皇古坟与早期古坟相比，陪葬品中多了很多大陆化的贵族生活物品，如金饰、玉饰等，还出现了马具。部分学者据此结合其它史料认为，5世纪以后的天皇和此前的天皇实际上并不属于同一个家族，目前的天皇家族是从北九州一带东征而来。
本人自我怀疑，可能是中原过来的人谋朝篡位夺的！(??????????)
部分史学家认为，天皇的起源最终可能还要从日本大和民族自身去寻找。
日本国内争议不断
日本人能容忍皇灵被“打扰”，而且可能有朝一日被告知天皇是外国人吗?关于日本天皇的起源，日本国内考古学界看法不一。
前些年，早稻田大学政治经济学四年级的保田德明认为，“以前宫内厅以怕打扰天皇灵魂安息为由拒绝开放天皇陵，这不过是个冠冕堂皇的理由罢了，背后肯定有对皇室真正血统的担心。但天皇对于日本人来说还是个比较神秘的存在，如果什么都公之于天下，多少会有些抵触感。”