和浙江巡抚双重管理。
不过浙江巡抚毕竟还要管理浙江民事，所以这两年，张科实际上已经成为浙江明军的最高指挥官。
其实就魏广德这些老乡来说，张科是唯一展现出军事文官素质之人，要是仕途通畅，未来当可为一镇总督人选。
之前不止是魏广德，就算兵部也从未注意到张科这方面的能力，不过在朝廷缉拿胡宗宪后，胡宗宪部游击营将军王应岐率部万余人出走武林，铤而走险发动军事哗变，妄图以此要挟朝廷。
张科用计图之，半夜带军队生擒叛将王应岐，审讯后，拟定奏章，将入奏朝廷，快速稳定局势。
不过，在书房魏广德抽出张科书信细看后却是皱眉，因为张科貌似惹祸了。